Kautokeino sokn er eier av tre kirkebygg; Kautokeino kirke, Máze kirke og Máze Zion.
Kautokeino sokn er deleier av Šuoššjávri kapell, sammen med Karasjok sokn og Norges Samemisjon.
Kautokeino menighet holder også gudstjenester i Láhpoluoppal kapell. Kapellets forvalter er Norges Samemisjon.